初，延平开府思明，军国大事，一日万几。分所部为七十二镇，令六官理国务，一时人才荟萃，庶绩咸熙。凡所便宜封拜，辄朝服北向，望永历帝座疏而焚之。克台之岁，改台湾为东都，置承天府，以杨朝栋为府尹，祝敬为天兴知县，庄之列为万年知县，设安抚司于澎湖，是为地方之制。又以周全斌总督承天府南北诸路，任官抚番，分管社事。纲纪振饬，制度修明，泱泱乎大国之风也。延平立法严，而爱民如子，劝之以忠，励之以勇，使之以义，绥之以和。闽、粤之民，闻风而至，拓地远及两鄙，台湾之人，以是大集。永历十六年，子经立。十八年，以谘议参军陈永华为勇卫，军国大事悉任之。永华为政儒雅，与民休息，改东都为东宁，天兴、万年为二州。二十年，圣庙成。三月，以永华为学院，叶亨为国子助教，教之、养之，台人自是始兴学。三十四年，永华卒。翌年，经薨，克塽幼，不能治国，以至于亡。
康熙二十二年，清人得台湾，议弃其地。靖海将军施琅疏陈不可，乃设府一、县三，隶福建。六十年，以朱一贵之变，特命巡视台湾满、汉御史各一员，监察行政。时漳浦蓝鼎元从军在台，以北路地方辽阔，治理失宜，议于半线增建一县，其言甚切。雍正元年，乃划虎尾溪以北，设彰化县及淡防同知，领地至蛤仔难，而垦者亦日至焉。当是时，土地初辟，横绝大海，往来多险，仕宦惮之。康熙三十年，诏曰：“台湾各官，自道员以下，教职以上，俱照广西南宁等府之例，将品级相当现任官员内拣选调补，三年俸满即升。如无品级相当堪调之员，仍归部选。著为令。”雍正七年，议准台湾道、府、同知、通判、知县到任二年，令该督抚于闽省内地拣选贤能之员，乘北风之时，令其到台，与旧员协办。半年之后，令旧员乘夏月南风之便，回至内地补用。政绩优著者准加级，称职者准加一级，以示鼓励。十二年，总督郝玉麟奏准，调台官员，年逾四十无子，准其挈眷赴任。